Gli uffici territoriali, secondo quanto previsto dal D.P.R. 20 gennaio 2009, n° 17, hanno compiti di supporto alle scuole, amministrativi e di monitoraggio. In particolare, svolgono le funzioni relative: alla assistenza, alla consulenza e al supporto, agli istituti scolastici autonomi per le procedure amministrative e amministrativo-contabili; alla gestione delle graduatorie e alla formulazione di proposte al direttore regionale ai fini dell’assegnazione delle risorse umane ai singoli istituti scolastici autonomi; al supporto e alla consulenza agli istituti scolastici per la progettazione e innovazione della offerta formativa e alla integrazione con gli altri attori locali; al supporto e allo sviluppo delle reti di scuole; al monitoraggio dell’edilizia scolastica e della sicurezza degli edifici; allo stato di integrazione degli alunni immigrati; all’utilizzo da parte delle scuole dei fondi europei; al raccordo ed interazione con le autonomie locali per la migliore realizzazione dell’integrazione scolastica dei diversamente abili, alla promozione ed incentivazione della partecipazione studentesca; al raccordo con i comuni per la verifica dell’osservanza dell’obbligo scolastico; alla cura delle relazioni con le RSU e con le organizzazioni sindacali territoriali.

Inoltre l’ufficio di Isernia provvede, tra l’altro, alla mobilità del personale docente ed ATA,  alla gestione degli esami di Stato e delle procedure di assunzione dei concorsi a cattedra, di cui al D.D.le del 31/3/99.